بررسی تنوع جمعیتی باکتری های اسید لاکتیک آش کارده با استفاده از روش تکثیر ژن S rRNA 16 و تعیین فعالیت ضد میکروبی ترکیبات شبه باکتریوسینی

نویسندگان
1 دانشیار و عضو هئیت علمی گروه علوم و صنایع غذایی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد
2 دانشجوی دکتری علوم و صنایع غذایی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد
3 استاد و عضو هئیت علمی گروه علوم و صنایع غذایی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد
4 عضو گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد
چکیده
چکیده هدف از این پژوهش شناسایی فلور لاکتیکی آش کارده به عنوان یک ماده غذایی سنتی-تخمیری، و سپس بررسی فعالیت ضد میکروبی برخی از سویه­ها بود. در مجموع 140 جدایه گرم مثبت و کاتالاز منفی انتخاب و برای گروه‌بندی آن‌ها، آزمون­های فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی و تخمیر کربوهیدرات (10 نوع متفاوت) انجام پذیرفت، بر اساس نتایج به دست آمده140جدایه به 9 گروه تقسیم­بندی شدند. از هر گروه چند جدایه انتخاب و ژن ناحیه 16SrRNA آن­ها به کمک پرایمر­های عمومی و با تکنیک PCR تکثیر داده شد. تنوع باکتری­های اسید لاکتیک آش کارده شامل: لاکتوباسیلوس فرمنتوم (%00/30)، لاکتوباسیلوس پلانتاروم (%57/28)، لاکتوباسیلوس برویس (%00/15)، ویسلا سیباریا (%57/8)، انتروکوکوس فاسیوم و فکالیس (%14/7)، لوکونوستوک سیترئوم و مزنتروئیدوس زیرگونه مزنتروئیدوس (%42/6) و پدیوکوکوس پنتوزاسئوس (%28/4) بود. فعالیت بازدارندگی بیست جدایه باکتری اسید لاکتیک به دست آمده از آش کارده در مقابل باکتری­های شاخص بیماری­زا مورد بررسی قرار گرفت. شانزده جدایه در روش نقطه گذاری و 14 جدایه در روش نفوذ در چاهک در برابر حداقل یکی از باکتری­های شاخص خاصیت بازدارندگی از خود نشان دادند. پنج جدایه که شامل گونه­های انتروکوکوس فاسیوم (1)، انتروکوکوس فکالیس (1)، پدیوکوکوس پنتوزاسئوس (1) و لاکتوباسیلوس پلانتاروم (2) بیشترین اثر آنتاگونستی را بر باکتری شاخص لیستریا اینوکوآ نشان دادند. فعالیت ضد میکروبی سوپرناتانت جدایه لاکتوباسیلوس پلانتاروم دارای بالاترین مقاومت حرارتی بود. همچنین دو جدایه انتروکوکوس فاسیوم و فکالیس فعالیت خود را در pH خنثی حفظ کرده بودند. فعالیت ضد میکروبی سوپرناتانت تنها سویه­ای که تحت تاثیر آنزیم پروتئینازK قرار نگرفت، مربوط به لاکتوباسیلوس پلانتاروم بود. نتایج نشان می­دهند از سوپرناتانت برخی جدایه­های مورد آزمون قرار گرفته می­توان به عنوان یک نگهدارنده طبیعی در محصولات غذایی استفاده نمود.
کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله English

Diversity of Lactic Acid Bacteria communities in “Ash kardeh" with using 16s rRNA gene sequence analysis and antimicrobial activity evaluation of like-bacteriocin compounds

نویسندگان English

Farideh Tabataba i Yazdi 1
Ali Reza Vasi i 2
Behrooz Ali Zadeh Behbahani 2
Seyed Ali Mortazavi 3
Foruzan Tabataba i Yazdi 4
چکیده English

The aim of this work was identified lactic floraas a traditional fermented food and then evaluates antimicrobial activities of some strains. A total of 140 Gram-positive and catalase-negative isolates were subjected to grouping by physiological and biochemical tests and carbohydrates fermentation. Based on the resultsthese 140 isolateswere dividedinto 9 groups. Two or three isolated were selected from each group and 16S rRNA was amplified using universal primers. Diversity of lactic acid bacteria in horreh was as followings:Lactobacillus fermentum (30.00%),Lactobacillus plantarum (28.57%), Lactobacillus brevis (15.00%), Weissellacibaria(8.57%),Enterococcus (faecium and faecalis) (7.14 %), Leuconostoc (citreumand mesenteroides subsp.Mesenteroides) (6.42%) and Pediococcus pentosaceus (4.28%). Antagonistic activity of 20 isolates (strains) of lactic acid bacteriaobtained fromhorreh was evaluated against food- borne bacteria. Sixteen isolates in Agar spot method and 14 isolates in well diffusion assayshowed antibacterial activity against at least one of these indicators. Eight isolates including:Ent. faecium (1), Ent. faecalis (1), P. pentosaceus(1) and Lb. plantarum (2) exhibited the highest antagonistic activity toward Listeria innocoa. Antagonistic activity of cell free supernatant (CFS) from Lb. plantarum showed the highest thermal stability. Also, two isolates belonging to:Ent. faecium, Ent. Faecalis presented antibacterial activity at pH=7. Only, the supernatant of Lb. plantarum was not influenced by proteinase K.The results showed that the supernatant of some isolatestestedcan be used as a bio preservative in food products.

کلیدواژه‌ها English

16s rRNA
Ash kardeh
lactic acid bacteria
Antagonistic activity
Bacteriocin